1998年，吴佩慈发行国语专辑《My Pace》，以此正式出道^{[3][4]。之后，陆续发行专辑《All my pace》《Look at me》《夜光航线》[12][13][14]。2000年，吴佩慈进军影视圈，首部作品为吴镇宇主演的电影《爱与诚》[15]。2002年参演徐熙媛主演的台湾偶像电视剧《流星花园Ⅱ》，饰演殷筱乔[16]。2008年，吴佩慈在吴镇宇执导的武侠电影《追影》中担任女主角“明月心”，另辟蹊径饰演了一个不同以往女侠形象的“史上最会撒娇的女侠”[17]。次年，加盟徐静蕾自导自演的时尚都市电影《杜拉拉升职记》，饰演杜拉拉的同事兼好姐妹海伦[18]。2013年4月，与白百合、彭于晏、蒋劲夫联合主演浪漫爱情电影《分手合约》，饰演了一个白富美完美女友形象[19]。该片公映后获得不错的票房和口碑，10天累计票房超1.45亿[20]。吴佩慈凭借该片获得第5届英国万像国际华语电影节最佳女配角奖提名[2]。}